河南省农业科学院园艺研究所, 郑州, 450002
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 6 篇
收稿日期: 2018年01月29日 接受日期: 2018年02月14日 发表日期: 2019年01月21日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 6 篇
收稿日期: 2018年01月29日 接受日期: 2018年02月14日 发表日期: 2019年01月21日
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摘 要
MYB 转录因子是一类参与调控次生代谢和细胞形态、增强抗病性和应对生物和非生物胁迫反应的蛋白家族。本研究依据小兰屿蝴蝶兰(Phalaenopsis equestris)基因组和蝴蝶兰‘大辣椒’(Phalaenopsis‘BigChili’)响应病毒胁迫转录组的测序结果,采用 Pfam、HMMER、OrchidBase 3.0 网站和 Bioedit、MEGA 5.1、Jalview 软件,对蝴蝶兰 MYB 家族基因进行了筛选和分类,分析了其基因类型、结构特点和系统进化关系,从小兰屿蝴蝶兰中筛选到 152 个 MYB 家族基因,其中 R2/R3 型 6 个、R2R3 型 138 个、R1R2R3 型 3 个。从大辣椒响应病毒胁迫转录组数据中共筛选得到 55 个 MYB 家族基因,其中有 7 个在响应不同时期差异表达明显,2 个 R2R3-MYB 亚家族基因在感染病毒初期和携带病毒时期大幅上调,3 个与小兰屿蝴蝶兰同源性较低。通过对小兰屿蝴蝶兰基因组和蝴蝶兰‘大辣椒’响应病毒胁迫时期 MYB 基因的筛选,为研究蝴蝶兰响应病毒关键 MYB 家族基因的分子功能提供了重要依据。
关键词
MYB 转录因子;蝴蝶兰;基因家族;病毒