李博 , 潘文婷 , 李康琴 , 李火根

南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室, 南京, 210037
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 14 篇   doi: 10.3969/mpb.011.000241
收稿日期: 2012年12月10日    接受日期: 2013年01月11日    发表日期: 2013年02月20日

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在亲本分析中，常用基于最大似然法的软件(如CERVUS, COLONY, PAPA)进行亲本推定，但不同软件各有其特点，其分析结果与亲本推定效率有时相差较大。为比较3种亲本分析软件(CERVUS3.0, COLONY2.0, PAPA2.0)的效率，本文以包含278个鹅掌楸潜在亲本及90个鹅掌楸已知亲本的子代群体为材料，利用13对EST-SSR引物对其进行分子检测，将3种软件推定的子代亲本与其真实亲本进行对照，进而评价各亲本分析软件的效率。研究结果表明，单亲(父本)分析时，CERVUS与COLONY软件分析效率较高；双亲分析时，采用PAPA 软件对异交子代分析结果较好，而CERVUS与COLONY软件则对自交子代分析效果较好。总体上，单亲分析的效率高于双亲分析。增加分子标记数量，或筛选多态性高的分子标记可提高双亲分析精度。

亲本分析；授粉；父本分析；双亲分析；CERVUS；COLONY；PAPA；鹅掌楸属