研究报告

水稻转录因子NF-YB 家族的生物信息学分析  

周天顺1,2* , 余东2,3,4* , 孙志忠2,3,4 , 孙学武2,3 , 谭炎宁2,3 , 盛夏冰2,3,4 , 段美娟4** , 袁定阳1,2,3**
1 湖南大学研究生院隆平分院, 长沙, 410125; 2 湖南杂交水稻研究中心杂交水稻国家重点实验室, 长沙, 410125; 3 湖南省农业科学院, 长沙,410125; 4 湖南农业大学农学院, 长沙, 410128
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2018年01月26日    接受日期: 2018年02月10日    发表日期: 2018年12月21日
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摘 要

转录因子 NF-YB (nuclear factor-YB)家族是核因子 Y (nuclear factor Y, NF-Y)家族的一个亚家族,在调控胚发育、形态建成、开花时间、株高、穗粒数等方面,尤其是在非生物胁迫应答中发挥着重要的作用。为揭示水稻 NF-YB 基因家族的信息及特征,加快基因家族功能挖掘进程,本研究利用生物信息学手段对该基因家族及其编码蛋白进行分析。结果表明,水稻中共有 13 NF-YB 基因,在染色体上分布不均匀,所编码的蛋白都定位在细胞核,且不含跨膜结构域或信号肽。多重序列比对,二级结构,三级结构以及基序分析表明,该家族成员保守性较高,均含有高度保守的CBF/NF-Y 结构域。进化分析表明 NF-YB 家族基因的分化早于物种的分化。磷酸化位点和互作蛋白网络分析初步预测了家族成员的互作蛋白网络。本研究为后期 NF-YB家族成员的功能研究,加快家族基因的实际应用进程提供了帮助。

关键词
水稻;转录因子;NF-YB 基因家族;生物信息学
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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