张国儒 , 庞胜群 ^* , 郭晓珊 , 单淑玲

石河子大学农学院园艺系, 特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室, 石河子, 832003
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2018年01月25日    接受日期: 2018年02月21日    发表日期: 2018年12月27日

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为筛选鉴定番茄叶片响应盐胁迫应答基因，本研究通过甲基磺酸乙酯(methyl ethyl sulfonate, EMS)诱变处理加工番茄‘JW9’获得的 16 株耐盐突变植株。经单独收种后，利用(RNA sequencing, RNA-Sep)技术对获得的耐盐突变体加工番茄幼苗叶片进行转录组测序分析。提取样品总 RNA 进行转录组 cDNA 文库制备后进行 Illumina HiSeq/MiSeq 测序。对转录组测序结果进行分析共获得了 102 Gb 大约 810 974 186 个高质量的 Clean 阅读序列，Cufflinks 软件重构转录本后得到 38 190 个已知转录本，1 647 个未知转录本。在测序样本中共筛选出 4 367 个基因在样品间显著差异表达，其中上调表达基因 2 606 个，下调表达基因 1 761 个。经qRT-PCR 检测表明，10 个随机选择的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)表达量变化与转录组测序结果一致。通过 GO和 KEGG 通路富集分析，从具有耐盐功能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶和 ATPase酶合成相关的基因中，找到 5 个显著差异表达基因 Solyc08g066270.1 和Solyc03g083420.2 以及Solyc10g018530.1、Solyc09g082890.1 和 Solyc02g014190.2 可能为耐盐相关基因。本研究从耐盐突变体与原始亲本的差异表达基因中筛选出耐盐候选基因，为进一步鉴定和克隆出番茄的耐盐基因培育耐盐品种番茄提供理论参考。
 

加工番茄；EMS；RNA-Seq；耐盐基因；qRT-PCR