1 浙江省农业科学院蔬菜研究所, 杭州, 310021; 2 浙江工商大学食品与生物工程学院, 杭州, 310021
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 3 篇
收稿日期: 2018年01月19日 接受日期: 2018年02月28日 发表日期: 2018年12月19日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 3 篇
收稿日期: 2018年01月19日 接受日期: 2018年02月28日 发表日期: 2018年12月19日
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摘 要
PIPs (plasmamembrane intrinsic proteins)是质膜内在蛋白,属于水通道蛋白的一个亚类,因其广泛参与植物逆境胁迫应答过程而备受关注。本研究对大豆 GmPIPs 基因进行了全基因组分析,主要包括成员鉴定、蛋白特性、保守结构域、进化关系、顺式作用元件、组织表达特性、干旱表达谱以及亚细胞定位分析。结果表明:从全基因组水平共鉴定到 22 个 GmPIPs。多序列比对显示所有 GmPIPs 基因编码的氨基酸均含有高度保守的特征结构域:6 个跨膜螺旋(TM-TM6)和 2 个氨基酸元件 NPA 盒(Asp-Pro-Ala box)。进化分析显示大豆 GmPIPs 主要划分为 2 个亚家族。顺式作用元件分析显示多数 GmPIPs 基因上游启动子区含有逆境和激素应答元件。组织表达分析显示多数 GmPIPs 基因在各个组织中广泛表达。QRT-PCR 分析发现在根中高表达的 8 个 GmPIPs 候选基因均受干旱胁迫的诱导表达。其中,GmPIP2;6 干旱应答最为明显。进一步的亚细胞定位显示 GmPIP2;6 蛋白定位在细胞膜上。以上研究结果为后续 GmPIPs 基因抗旱功能的研究及生产利用提供了理论依据。
关键词
菜用大豆;PIPs;组织表达;干旱响应;亚细胞定位