蒋边¹ , 潘嘉琪¹ , 叶柳清¹ , 陆丽施¹ , 袁长春¹ , 刘锴栋^1,2*

1 岭南师范学院, 生命科学与技术学院, 湛江, 524048; 2 湖南农业大学, 生物科学技术学院, 长沙, 410128
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2018年01月09日    接受日期: 2019年02月07日    发表日期: 2019年01月22日

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为了获得番木瓜果实转录组数据及预测关键基因功能。本研究通过 Illumina HiSeqTM 2500 高通量测序技术平台对番木瓜果实中提取的总 RNA 进行测序，获得了平均值为 36 770 860.67 个原始 reads。经过滤、从头组装和拼接获得了 54 941 条高质量 Unigene，平均长度为 921 bp，N50 的值为 1 770。对所得 Unigene 进行不同数据库注释，30 592 个和 24 467 个 Unigene 分别在 NR 和 Swiss-Prot 数据库有同源比对信息，确定了番木瓜同源序列所属物种；在 KOG 数据库中共有 29 974 个 Unigene 被注释上 25 种功能，其中涵盖基因最多的是一般功能预测；114 207 个 Unigene 被注释到生物学过程、细胞组分及分子功能的 GO 数据库三大类别的 48 个功能组，其中大量 Unigene 与细胞过程、代谢过程、细胞部分、细胞催化及结合相关；根据 KEGG数据库，可将 11 766 个 Unigene 定位到 130 个代谢途径分支，其中大部分的基因都与氨基酸、碳水化合物、脂类以及核苷酸的代谢相关。本研究结果将为进一步开展番木瓜果实的相关代谢途径、激素信号传导途径以及生物活性物质的合成途径中关键基因的挖掘提供理论参考。

番木瓜；转录本；转录组测序；功能注释