1 中国农业科学院烟草研究所, 烟草行业基因资源利用重点实验室, 青岛, 266101; 2 中国农业科学院研究生院, 北京, 100081; 3 曲靖市烟草公司, 曲靖, 655000; 4 陕西中烟工业有限责任公司, 西安, 710000
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 4 篇
收稿日期: 2018年01月12日 接受日期: 2018年02月14日 发表日期: 2019年01月15日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 4 篇
收稿日期: 2018年01月12日 接受日期: 2018年02月14日 发表日期: 2019年01月15日
© 2018 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要
SBP 转录因子家族是植物特有的一类转录因子家族,主要参与植物生长、发育和多种生理生化过程的信号传导。马铃薯是一种重要的经济和粮食作物,但马铃薯 SBP 转录因子家族的分析尚未见报道。本研究利用生物信息学技术,对马铃薯基因组进行分析,在马铃薯中共鉴定出 16 个 SBP 转录因子,并对其系统进化关系、编码基因结构以及基因表达模式进行研究。系统进化分析表明,马铃薯和拟南芥 SBP 转录因子家族成员共 31 个成员,被分成 7 个亚家族(Subgroup);结构分析表明,同一亚家族内的成员的蛋白保守结构域的类别、组成以及编码基因的基因结构具有高度的相似性,但不同亚家族的成员差异较大;基因表达分析表明,编码 SBP 转录因子家族成员的基因表达模式具有明显的时空特异性,且成员对不同的激素处理有不同的响应模式。本研究为进一步研究马铃薯 SBP 转录因子的功能以及可能的调控机制研究提供了理论依据。
关键词
SBP转录因子家族;马铃薯;拟南芥;生物信息学