1云南农业大学农学与生物技术学院,昆明, 650201; 2 云南农业大学烟草学院,昆明, 650201; 3云南省烟草农业科学研究院,昆明, 650000
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 1 篇
收稿日期: 2017年12月25日 接受日期: 2018年01月31日 发表日期: 2019年05月23日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 1 篇
收稿日期: 2017年12月25日 接受日期: 2018年01月31日 发表日期: 2019年05月23日
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摘 要
WRKY基因家族是一类含有 WRKY保守结构域的转录因子(transcription factors, TFs),在植物的生长发育、胁迫应答等过程中起着重要的作用。目前,已在多种植物中鉴定了 WRKY基因家族,但是研究烟草中与发育相关的WRKY转录因子功能预测并不多。本研究通过对旺长期(P)、成熟期(M)、衰老 1期(M1)、衰老2期(M2)的烟草叶片进行转录组测序,共获得 122个 WRKY转录因子。利用多种生物信息学软件对家族成员进行了去冗余处理后得到26条WRKY转录因子,进行结构域分析、家族分析、系统进化树分析,结果显示,可将26个候选NtWRKY蛋白分为玉、 域和芋3个亚家族。通过表达量分析显示,在 3个亚家族中与逆境胁迫功能相关的WRKY转录因子多与叶片衰老存在正相关,可以预测为衰老相关基因。本研究不仅为研究普通烟草 WRKY 转录因子在调控生长发育过程中的作用提供了相关的科学依据,也为进一步分析烟草WRKY基因提供了有价值的信息和表达研究。
关键词
WRKY转录因子;叶片衰老;转录组