陈国梁^1,2* , 祖欢欢¹ , 张昊¹ , 薛宝平¹ , 任彤¹ , 周翀¹

1 延安大学生命科学学院, 延安, 716000; 2 陕西省红枣重点实验室, 延安, 716000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2018年01月09日    接受日期: 2018年02月05日    发表日期: 2018年08月16日

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推荐引用：

Chen G.L., Zu H.H., Zhang H., Xue B.P., Ren T., and Zhou C., 2018, Bioinformatics aanalysis of the GATA transcription
factor family in Ziziphus jujube, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(15): 4863-4871 (陈国梁, 祖欢欢, 张昊, 薛宝平, 任彤, 周翀, 2018, 枣 GATA 转录因子家族生物信息学分析, 分子植物育种, 16(15): 4863-4871)

为了深入研究枣 GATA 转录因子家族的基因功能以及为枣的分子育种提供科学依据。本研究利用NCBI、TAIR、Planttfdb、HMMER、Pfam、SMART、MEME、GSDS、Plant Care、STRING 在线网站以及 DNAMAN6、MapInspect 和 MEGA5 软件，对枣 GATA 转录因子的个数、理化特征、染色体定位、系统进化树、保守基序、基因结构和蛋白功能联系预测进行了分析。结果表明：枣含有 28 个 GATA 转录因子，根据结构域的不同分为四个亚族：Group玉、Group域、Group芋和 Group郁。其中 Group芋和 Group 郁处在进化树的同一分支。另外，枣 12 条假染色体上共鉴定到 7 条染色体分布有枣 GATA 基因(22 条)，其中第 6 条、第 8 条、第 9 条和第10条染色体分布最多(4 个)，第 12 条分布最少(1 个)。同一亚类里枣 GATA 转录因子含有相同的保守基序，基因结构也比较相似。本研究对于进一步认识枣 GATA 单个基因的功能以及基因之间的功能、基因进化和分子育种具有重要的意义。

枣； GATA； 转录因子； 生物信息学