研究报告

基于转录组数据对陆地棉GhHMP1的克隆及表达分析  

韩明格1,2 , 王晓歌2 , 杨笑敏2 , 王德龙2 , 王俊娟2 , 王帅2 , 郭丽雪2 , 樊伟丽2 , 陈超2 , 叶武威2*
1新疆农业大学农学院,乌鲁木齐, 830052; 2中国农业科学院棉花研究所,棉花生物学国家重点实验室,安阳, 455000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2017年12月27日    接受日期: 2018年01月06日    发表日期: 2018年12月19日
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摘 要

本研究就转录组数据分析得到一个与镉胁迫相关的基因GhHMP1 (Heavy metal transport/detoxifica- tion superfamily protein1),并从陆地棉耐镉品种‘邯 242’中克隆成功。为研究该基因的功能和特点,对其进行生物信息学分析、转录组分析和实时荧光定量表达分析。结果表明:陆地棉‘邯 242’基因 GhHMP1的 CDS全长为 402 bp,编码 133 个氨基酸,分子量约为 14.88 kD,等电点为 8.20;转录组和实时荧光定量分析表明,GhHMP1基因的表达具有组织特异性,且受镉胁迫诱导,可以作为重要的候选基因来培育棉花耐镉新材料,从而为棉花耐镉育种及修复重金属污染土壤提供重要的理论依据。

关键词
棉花;镉胁迫; GhHMP1;基因克隆;表达分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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