成熟软化期苦瓜果实均一化全长cDNA文库的构建与EST分析 
高山 
,
陈桂信 ,
许端祥 ,
林义章 
,
潘东明
,
陈桂信 ,
许端祥 ,
林义章 ,
潘东明
1 福建农林大学园艺产品贮藏保鲜研究所, 福州, 350002;
2 福州市蔬菜科学研究所, 福州, 350111;
3 福建农林大学园艺学院, 福州, 350002
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 10 篇 doi: 10.3969/mpb.011.000211
收稿日期: 2012年12月26日 接受日期: 2013年01月09日 发表日期: 2013年02月04日
2 福州市蔬菜科学研究所, 福州, 350111;
3 福建农林大学园艺学院, 福州, 350002
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 10 篇 doi: 10.3969/mpb.011.000211
收稿日期: 2012年12月26日 接受日期: 2013年01月09日 发表日期: 2013年02月04日
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摘 要
以苦瓜(Momordica charantia L.) 1/4黄期果实为材料，采用DSN (duplex-specific nuclease)均一化与SMART (switching mechanism at 5′endof RNA transcript)技术相结合，构建成熟软化期苦瓜果实均一化全长cDNA文库。经检测，该文库的转化效率为3 600 000个菌落/µL连接产物，其平均插入片段大小为1.4 kb，重组率为98.0%，表明文库质量较好。随机挑取768个克隆进行EST测序，获得有607个高质量的EST，其中17个contig和562个singleton。冗余率为7.41%，文库的全长率67%。对测序结果进行注释和归类分析表明，已知功能基因大部分与催化活性、蛋白结合、转录调节活性、转运活性和酶调控活性有关分析结果表明文库的可靠性好，发现有若干个与胞内蛋白质降解、细胞壁代谢乙烯合成、信号传导和抗逆等可能与苦瓜果实成熟软化相关的新基因。
关键词
苦瓜(Momordica charantia L.)；果实成熟软化；均一化；cDNA文库；EST
