1 中国林科院资源昆虫所, 昆明, 650224; 2 西南林业大学园林学院, 昆明, 650224; 3 云南农业大学农学与生物技术学院, 昆明, 650201
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 16 篇
收稿日期: 2017年12月06日 接受日期: 2018年01月30日 发表日期: 2019年08月15日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 16 篇
收稿日期: 2017年12月06日 接受日期: 2018年01月30日 发表日期: 2019年08月15日
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摘 要
为了克隆滇重楼编码 3- 羟基 -3- 甲基戊二酰辅酶 A 还原酶(HMGR)的基因,并分析其在滇重楼不同组织中差异表达。本研究采用 RT-PCR 的方法从滇重楼根茎中克隆到编码 HMGR 的基因全长序列,用生物信息学的方法对 HMGR 蛋白进行理化性质、蛋白结构及功能的预测分析,并对该蛋白进行相似性检索、构建进化树;利用实时荧光定量的方法检测该基因在滇重楼不同组织中的差异表达。结果获得了全长 1 494 bp的 ORF,编码 497 个氨基酸,命名为 PpHMGR (GenBank 登记号: MG601751)。PpHMGR 编码的蛋白含有NADPH 结合基序和底物 HMG-CoA 结合基序,属于 3- 羟基 -3- 甲基戊二酰辅酶 A 还原酶家族。PpHMGR在根茎的表达量明显高于叶片、茎和芽,其中在 3 年生根茎的表达量又明显高于 1 年和 5 年生根茎。本研究从滇重楼中克隆了 PpHMGR 基因,为进一步鉴定基因功能、探讨滇重楼皂苷的合成生物学研究提供了科学依据。
关键词
滇重楼;甾体皂苷;3- 羟基 -3- 甲基戊二酰辅酶 A 还原酶(HMGR);基因克隆;表达分析