番茄查尔酮合成酶基因的鉴定及生物信息学分析  

阮美颖 , 万红建 , 叶青静 , 王荣青 , 姚祝平 , 周国治 , 俞锞 , 袁伟 , 刘云飞 , 杨悦俭
浙江农业科学院蔬菜研究所, 杭州, 310021
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 14 篇   doi: 10.3969/mpb.011.000379
收稿日期: 2012年12月21日    接受日期: 2013年03月27日    发表日期: 2013年04月15日
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摘 要

查尔酮合成酶(Chalcone synthase, CHS, EC2.3.1.74)是植物类黄酮合成途径中的第一个关键酶,在植物生长发育过程中扮演着重要的作用。本研究基于番茄全基因组测序数据,鉴定查尔酮合成酶基因家族成员,分析其内含子-外显子结构特征及系统发育关系,序列结构的保守性,以及它们在染色体上的分布及其表达方式。研究表明:番茄全基因组共含有8个查尔酮合成酶(SlCHS)基因,基因结构分析发现这些基因均含有较少的内含子(0-2个);序列比对表明这些基因具有较高的保守性;它们不均匀分布在番茄的1、5、6、9、12号染色体上;芯片表达谱分析表明SlCHS基因家族成员不仅参与了番茄根、子叶和真叶等不同组织类型的生长发育,而且还参与了番茄对环境胁迫的反应。

关键词
番茄;查尔酮合成酶;生物信息学;表达分析
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《分子植物育种》印刷版
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