逄洪波¹ , 解元坤¹ , 张璐¹ , 李玥莹¹ , 马纯艳¹ , 何文秀¹ , 高秋^2*

1 沈阳师范大学生命科学学院, 沈阳, 110034; 2 农业部全国草业产品质量监督检验测试中心, 北京, 100125
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《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 26 篇   
收稿日期: 2017年12月15日    接受日期: 2018年01月03日    发表日期: 2018年12月20日

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鬼针草(Bidens bipinnata L.)作为一种重要的药用植物，在属内鉴别和临床用药安全上存在较大问题。本研究利用 Trinity 软件对鬼针草转录组数据进行组装，共得到总长为 106 457 436 bp 的 120 122 条unigenes。利用 MISA 软件寻找到 17 140 个含有 SSR 的重复基元。SSR 位点中主要重复序列为单核苷酸和三核苷酸，分别占总 SSR 位点的 38.73%和 38.06%，其次是二核苷酸，占 20.73%。利用 Primer 3.0 设计引物，从中随机选择 50 对引物进行 PCR 扩增。其中有 28 对扩增出清晰条带，多态性好，重复性好。鬼针草转录组的SSR 分子标记将会对鬼针草属植物种质资源鉴定、遗传多样性、重要性状基因定位及分子标记辅助选择育种等起重要推动作用。

鬼针草；SSR；转录组；标记开发