研究报告

大白菜漆酶基因家族(BrLAC)全基因组鉴定与生物信息学  

王虹云1 , 李涛1* , 张丽莉1 , 姚建刚1 , 夏秀波1 , 曹守军1 , 周杨2
1 山东省烟台市农业科学研究院, 烟台, 265500; 2 烟台大学生命科学学院, 烟台, 264005
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2017年12月22日    接受日期: 2018年01月11日    发表日期: 2019年01月16日
© 2018 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要

本研究利用生物信息学方法对大白菜的漆酶(p-diphenol oxadise or laccase, LAC)基因家族成员、染色体定位、基因结构、进化树、氨基酸序列及同源表达情况进行了相关分析。结果显示,15 个大白菜漆酶基因(BrLAC)家族成员分布于 7 条染色体上,部分基因存在串联复制现象;基因结构分析显示,该家族基因含 2~6个内含子;亚细胞定位及跨膜结构分析表明,BrLAC 无跨膜区或仅有一个很短的跨膜区域,主要定位于细胞外及周质;氨基酸序列分析结果表明 BrLAC 氨基酸序列均含有漆酶的 3 个典型保守结构域,4 个铜离子结合位点;通过与拟南芥 LAC 进行系统发生分析,将其分为 6 个亚族;同源分析 LAC 在不同组织中的表达情况表明 LAC 在根系和果荚中的表达量较高,在花及叶片中的表达量较低。大白菜漆酶可能代替多酚氧化酶直
接参与酶促褐变,值得深入研究。

关键词
大白菜;BrLAC;生物信息学;同源表达
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
王虹云1
.
李涛1*
.
张丽莉1
.
姚建刚1
.
夏秀波1
.
曹守军1
.
周杨2
相关论文
.
大白菜
.
BrLAC
.
生物信息学
.
同源表达
服务
. 发表评论