研究报告/Research Report

醋栗番茄NHX4基因及其启动子序列的克隆与分析  

李红婷 , 魏露阳 , 孙亚东 , 朱路英*
鲁东大学农学院, 烟台, 264000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2017年11月24日    接受日期: 2017年12月24日    发表日期: 2018年08月06日
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推荐引用:

引用格式:Li H.T., Wei L.Y., Sun Y.D., and Zhu L.Y., 2018, Cloning and analysis of the vacuolar Na+/H+ antiporter 4 gene and its promoter from Solanum pimpinellifolium, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(14): 4511-4519 (李红婷, 魏露阳, 孙亚东, 朱路英, 2018, 醋栗番茄 NHX4 基因及其启动子序列的克隆与分析, 分子植物育种, 16(14): 4511-4519)  

摘 要

本研究在醋栗番茄基因组鸟枪序列的基础上,基于同源序列的保守性,克隆了醋栗番茄液泡膜Na+/H+ 逆向转运蛋白4(SpNHX4)基因的cDNA序列;对其响应盐胁迫的表达模式进行了分析;通过染色体步行法克隆了该基因的启动子区域;并通过生物学软件对该基因编码的蛋白和启动子序列进行分析。结果显示,SpNHX4的cDNA序列包含1611bp的开放阅读框,编码536个氨基酸。SpNHX4多肽链中疏水性氨基酸占多数,具有12个明显的跨膜结构区, 符合跨膜蛋白的特征。荧光定量 PCR结果显示,在NaCl胁迫条件下,SpNHX4在醋栗番茄根、茎和叶中的表达均上调,其中在叶中的表达量变化最为显著。通过PlantCARE软件对SpNHX4上游1857bp的启动子序列进行顺式元件预测,发现该启动子区域包含番茄典型的TATA-box“TTTTA”序列和CAAT-box转录增强子序列“CCAAT”。此外,还存在多个与激素、逆境、光诱导相关的元件。这些结果为进一步研究SpNHX4的功能和转录调控机制提供资料。

关键词
醋栗番茄;液泡膜 Na+/H+ 逆向转运蛋白 4;基因克隆;启动子;生物信息学分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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