研究报告/Research Report

白三叶质子焦磷酸酶基因 TrVP1 生物信息学分析及定量表达  

雍斌 , 覃晓李 , 张艳 , 吴星 , 李州 , 贾彤 , 彭燕*
四川农业大学动物科技学院草业科学系, 成都, 611130
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2017年11月24日    接受日期: 2018年01月15日    发表日期: 2018年08月16日
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推荐引用:

Yong B., Qin X.L., Zhang Y., Wu X., Li Z., Jia T., and Peng Y., 2018, Bioinformatics analysis and quantitative expression
of proton pyrophosphatase gene
TrVP1 from Trifolium repens cv.Ladino, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(15):4899-4909 (雍斌, 覃晓李, 张艳, 吴星, 李州, 贾彤, 彭燕, 2018, 白三叶质子焦磷酸酶基因 TrVP1 生物信息学分析及定量表达, 分子植物育种, 16(15): 4899-4909)

摘 要

质子焦磷酸酶(H+-PPase)在提高植物抗逆性方面发挥着重要的作用。本试验以白三叶品种‘拉丁诺’(Trifolium repens cv. Ladino) cDNA 为模板克隆出了白三叶 H+-PPase 基因 TrVP1 的全长序列,并利用相关分析软件和网站对其进行生物信息学分析,并研究它在非生物胁迫及信号物质诱导下的表达模式。结果表明,TrVP1 全长为 2 594 bp,开放阅读框(ORF)2 304 bp,共编码 767 个氨基酸;其编码蛋白为亲水性跨膜蛋白,分子量 80.49 kD,等电点 pI 5.18,多序列比对及系统进化树分析显示该基因属于VP 家族。采用荧光定量(qRT-PCR)方法分析 TrVP1 的表达模式发现,重金属(CdSO4)、低温(4)、高温(35)、干旱(PEG-6000)和盐(NaCl)胁迫均显著上调了白三叶根系中 TrVP1 的表达量,但下调了叶片中 TrVP1 的表达量。此外,白三叶根系中 TrVP1 的表达受到 Ca2+ 信号的显著诱导,而叶片中的 TrVP1 表达则受到抑制。与此同时,NO H2O2信号对白三叶根系和叶片中 TrVP1 的表达均起到抑制作用。本试验为深入研究质子焦磷酸化酶基因,提高白三叶抗逆性的功能及其应用提供了理论依据。

关键词
白三叶; 氢离子焦磷酸化酶; 基因克隆; 信息学分析; 定量表达
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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