研究报告/Research Report
菜豆SBP-box基因家族的分子特征与进化分析 
胡利宗1,2 
,
王俊生 1 ,
刘红占1 ,
赵锦慧1 ,
王秋霞1 ,
纪秀娥1* 
,
王俊生 1 ,
刘红占1 ,
赵锦慧1 ,
王秋霞1 ,
纪秀娥1*
1 周口师范学院, 生命科学与农学学院, 周口, 466001; 2 周口师范学院, 河南省作物分子育种与生物反应器重点实验室, 周口, 466001
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 2 篇
收稿日期: 2017年11月17日 接受日期: 2017年12月08日 发表日期: 2018年08月02日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 2 篇
收稿日期: 2017年11月17日 接受日期: 2017年12月08日 发表日期: 2018年08月02日
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推荐引用：
引用格式：Hu L.Z., Wang J.S., Liu H.Z., Zhao J.H., Wang Q.X., and Ji X.E., 2018, Molecular characteristic and evolution analysis of the SBP gene family in common bean, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(14): 4489-4497 (胡利宗, 王俊生, 刘红占, 赵锦慧, 王秋霞, 纪秀娥, 2018, 菜豆 SBP-box 基因家族的分子特征与进化分析, 分子植物育种, 16(14): 4489-4497)
摘 要
SBP 蛋白是植物特有转录因子，参与众多生物学过程。尽管在许多植物中 SBP 家族基因已经被鉴定，但在菜豆中仍然未见报道。本研究为探索菜豆 SBP-box 基因家族，基于生物信息学手段充分挖掘菜豆基因组和转录组数据资源，鉴定出 23 个菜豆 SBP 基因，并系统分析了这些 SBP 基因的结构、定位、保守基序、表达和系统进化关系。结果表明：23 个基因被分为 2 个大类群，散落分布在 10 条染色体上；菜豆、拟南芥和水稻 SBP 蛋白共存在 16 种类型保守基序组成类型；菜豆 SBP 基因结构种类有 5 种，其外显子数目分别为2、3、4、9 和 10 个；基于 RNA-seq 测序数据的表达分析表明菜豆 SBP 基因表达具有高度多样化特征，这说明参与许多生物学过程。本研究为菜豆 SBP 基因功能研究提供重要线索。
关键词
菜豆；基因家族；SBP 基因；转录因子
