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《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 9 篇
收稿日期: 2017年11月04日 接受日期: 2017年11月26日 发表日期: 2018年08月07日
引用格式:Ying Y.B., Zhu Y.Y., Guo W.D., Chen W.R., Zong Y., Zhang T., Tang T.Y., and Li Y.Q., 2018, Identification and
expression analysis of bHLH transcription factor gene family in Prunus pseudocerasus Lindl., Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular PlantBreeding), 16(14): 4559-4568 (应炎标, 朱友银, 郭卫东, 陈文荣, 宗宇, 张婷, 汤腾跃, 李永强, 2018, 樱桃 bHLH 转录因子家族基因鉴定及表达分析, 分子植物育种, 16(14): 4559-4568)
低温被认为是诱导‘短柄樱桃’花芽休眠解除的关键因子,而花芽如何响应低温并完成积累仍不清楚。植物 bHLH 转录因子可以响应低温而调控植物生长发育和非生物胁迫过程。研究小组在‘短柄樱桃’花芽转录组文库中发现了 30 个具有完整开放阅读框的 bHLH 类转录因子,但其结构特征和低温诱导表达模式仍不清楚。为此,本研究采用生物信息学方法对 30 个 bHLH 转录子的基因结构和氨基酸序列进行分析,发现编码基因的开放阅读框在 594~2 190 bp 之间,可编码 197~729 个氨基酸序列。氨基酸保守基序分析发现 25 个出现频率高于 50%的保守位点,属于 bHLH 典型结构域序列特征。利用保守域序列构建系统进化
树,加入氨基酸序列相似度较高的 30 个桃 bHLH 家族成员及 26 个拟南芥 bHLH 家族成员,樱桃 bHLH 转录因子被分为 9 个亚族,其中第芋组成员最多,主要涉及 ABA 的信号转导途径及逆境响应。实时定量表达分析发现,所有基因表达均呈先上升后下降趋势,只是幅度不同,最高点均出现在低温处理 192 h,说明 30 个bHLH 转录因子均受低温诱导表达,可能参与低温诱导花芽休眠解除分子调控,但其调控机制还需进一步研究。本研究为探明中国樱桃 bHLH 转录因子功能提供理论依据。