海南粗榧GGPPs基因克隆与诱导表达分析  

钱丹1 , 江雪飞1 , 乔飞2
1热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室, 海南大学园艺园林学院, 海口, 570228;
2中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所, 农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室, 儋州, 571737
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 9 篇   doi: 10.3969/mpb.011.000204
收稿日期: 2012年10月19日    接受日期: 2012年11月07日    发表日期: 2013年01月25日
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摘 要

濒危植物海南粗榧富含多种抗癌活性次生代谢产物。为研究这些产物的生物代谢途径和表达调控,通过同源克隆和RACE技术获得了海南粗榧紫杉醇生物合成途径中通用前体牻牛儿基牻牛儿焦磷酸合成酶(GGPPs)基因全长并进行了生物信息学分析。该基因命名为CmGGPPs (GenBank登录号: JX971119),并进一步利用不同激发子诱导研究了该基因对不同逆境信号的响应情况。结果表明:海南粗榧GGPPs基因cDNA全长1 694 bp,包含一个1 182 bp的ORF框,编码393个氨基酸;预测该基因编码蛋白质分子量为42.91 kD,其等电位为7.12。通过BLAST比对结果分析,海南粗榧GGPPs基因全长核苷酸序列与红豆杉科植物的同源性最高可达91%,氨基酸序列有89%的相似性。同时,GGPPs基因氨基酸序列同其他植物也有较高的同源性。用不同类型激发子处理发现,GGPPs在诱导后表达量均上升,但不同激发子诱导的基因表达强度和速率存在明显区别。 

关键词
海南粗榧;GGPPs基因;诱导表达;RACE技术
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《分子植物育种》印刷版
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