研究报告
蓖麻 RcGA20ox1 基因克隆及生物信息学分析 
丛安琪1 
,
李国瑞1,2,3,4 ,
王月5 ,
李威5 ,
李晓晨5 ,
黄凤兰1,2,3,4 ,
陈永胜 1,2,3,4 
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李国瑞1,2,3,4 ,
王月5 ,
李威5 ,
李晓晨5 ,
黄凤兰1,2,3,4 ,
陈永胜 1,2,3,4
1 内蒙古民族大学生命科学学院, 通辽, 028000; 2 内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心, 通辽, 028000; 3 内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室, 通辽, 028000; 4 内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心, 通辽, 028000; 5 内蒙古民族大学农学院, 通辽, 028000
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 4 篇
收稿日期: 2017年10月12日 接受日期: 2017年11月12日 发表日期: 2018年06月28日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 4 篇
收稿日期: 2017年10月12日 接受日期: 2017年11月12日 发表日期: 2018年06月28日
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摘 要
GA20 氧化酶是赤霉素生物合成途径中的重要氧化酶，我们尝试克隆该酶，发掘蓖麻中 GA20ox 家族候选基因，并推测其功能。根据 NCBI 上已知蓖麻 GA20ox1 基因(XM_002510827.2)序列设计引物，扩增得到 GA20ox 基因片段，连接 pMD18-T 载体，得到 RcGA20ox1 cDNA 完整的开放阅读框序列 1 137 bp，并对其进行序列比对、转录物理化性质分析、疏水性、功能域分析及其三级结构预测。推测其可编码 378 个氨基酸，为亲水性稳定蛋白；基因隶属 PcbC superfamily 家族，为非分泌蛋白、细胞质蛋白、含有 28 个磷酸化位点；预测结构由 8 个 琢- 螺旋和 8 个 茁- 折叠构成；与大戟科巴西橡胶树、木薯和麻疯树高度同源。本研究为蓖麻GA 生物合成乃至蓖麻矮化相关研究提供一定的理论与实践依据。
关键词
蓖麻；GA20ox；基因克隆；生物信息学分析
