番茄全基因组SBP基因家族的鉴定、结构特征及表达分析  

万红建 , 袁伟 , 俞锞 , 刘云飞 , 李志邈 , 叶青静 , 王荣青 , 阮美颖 , 姚祝平 , 杨悦俭
浙江省农业科学院蔬菜研究所, 杭州, 320021
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 2 篇   doi: 10.3969/mpb.011.000299
收稿日期: 2012年12月04日    接受日期: 2012年12月12日    发表日期: 2013年02月04日
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摘 要

SBP基因家族是植物中一类特有的转录因子家族,广泛参与植物的生长发育以及各种生理生化反应的信号传导。为了揭示番茄SBP基因家族的功能,本研究利用全基因组信息鉴定番茄SBP转基因子家族,分析结构特征,系统发育关系以及表达模式。结果表明,番茄全基因组共编码17个SBP转录因子成员,分布在8条染色体上;系统发育关系表明SBP基因家族的结构特征发生在番茄、拟南芥和水稻分化之前;随后,它们在番茄、拟南芥和水稻中按照物种特异性的方式进行了扩张。不同类型的芯片分析发现SlSBP03基因在番茄叶片、子叶和下胚轴中表达量较高,SlSBP13基因果肉中表达量较高,这两个基因在果皮和根中表达量都较低;在大多数非生物胁迫处理条件下,SlSBP11SlSBP13SlSBP16的表达量均较低;而SlSBP01基因在干旱和热处理条件下有较高的表达量。

关键词
番茄;SBP基因家族;生物信息学;水稻;拟南芥
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《分子植物育种》印刷版
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