陈赫 , 吴友根^* , 杨豫章 , 庞真真 , 张军锋 , 于靖

海南大学热带农林学院, 海口, 570228
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2017年10月09日    接受日期: 2017年11月03日    发表日期: 2018年04月21日

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为了进一步阐明广藿香中药用活性成分生物合成的分子机制。本研究以海南广藿香幼叶及成熟叶片为材料，采用BGISEQ-500高通量测序平台进行转录组测序，分别获得了63 751 826条和65 949 390条clean reads，平均读长为90 nt。De novo组装后将All-unigene分别注释到Nr、KOG、GO、KEGG、Swiss-Prot、InterPro数据库，对每个数据库注释的unigene数目进行统计，共有162 509条unigene有对应的功能信息，其中105 430条unigene被注释到Nr数据库，显示与芝麻有69.87%的相似度；有83 369条unigene被注释到KOG数据库，根据功能将其分为25类；有12 261条unigene与GO数据库中的基因具有相似性，将其归为3大类中49个功能组；有79 053条unigene被注释到KEGG的代谢通路中，分属于124类代谢通路，包括次生代谢物质生物合成、倍半萜和三萜类化合物生物合成、黄酮和黄酮醇生物合成、花青素生物合成等。该研究结果对广藿香药用活性成分生物合成与代谢、关键酶基因克隆以及分子标记开发等研究有一定的帮助。

广藿香；转录组；基因功能