赵志新^* , 高利敏

商洛学院生物医药与食品工程学院, 商洛, 726000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2017年11月09日    接受日期: 2017年12月13日    发表日期: 2018年12月27日

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串联重复序列(tandem repeats, TRs)在玉米基因组中广泛存在，对维持染色体结构和调节基因表达起到重要作用。从 Phytozome (http://www.phytozome.net/)下载玉米全基因组序列和基因注解(Gene annotation)数据，然后使用串联重复序列分析工具(Phobos)检测 TRs 的密度变化、模体类型及其在基因内与基因间的位置分布情况。研究表明，5'UTR 和启动子中的 TRs 密度最高，内含子(Intron)和编码区(CDS)中 TRs 密度相对较低。同时 TRs 主要分布于 CDS 两端，这可能与内含子剪接有关；在基因间隔区，串联重复序列的分布明显偏向于靠近基因。本研究对串联重复序列在植物基因组中的特征及作用及有借鉴作用。
 

串联重复序列；玉米；密度；分布