研究报告

乌拉尔图小麦(Triticum urartu)多药抗性基因 TuPDR7 的生物信息学分析  

侯文倩1* , 杜旭烨1 , 张磊2 , 郭娟1 , 谢玫瑰1 , 李小梅1 , 蒋克云1
1 贵州师范大学生命科学学院, 贵阳, 550025; 2 华中农业大学园艺林学学院, 武汉, 430070
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2017年09月21日    接受日期: 2017年11月29日    发表日期: 2019年01月19日
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摘 要

多药抗性基因(pleiotropic drug resistance, PDR)ATP-binding Cassette (ABC)转运蛋白基因三大亚家族中的一个,具有对生物和非生物胁迫的广谱抗性。本研究以乌拉尔图小麦为材料,以小麦 TaPDR7基因序列为探针,在乌拉尔图小麦的 DNACDS 和氨基酸序列数据库中搜索到同源序列,命名为 TuPDR7,并对其进行生物信息学分析。结果表明,TuPDR7 4 140 bp,编码 1 379 个氨基酸,预测其蛋白分子量为155.5 kD,等电点为 6.1,是一个膜蛋白。同源序列比对和三级结构预测显示 TuPDR7 具有 PDR 基因典型的结构域。启动子预测表明 TuPDR7 含有对禾谷镰刀菌等真菌、脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)、生物激素、盐胁迫、冷胁迫、干旱胁迫等的响应元件,说明其可能是一个广谱抗性基因,对于乌拉尔图小麦的抗性研究具有重要意义。

关键词
乌拉尔图小麦;多药抗性基因;TuPDR7;生物信息学分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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