研究报告/Research Report
割手密SsREMO-1基因的克隆与等位变异分析 
刘洋1,2,3* 
,
姚艳丽2,3 
,
胡小文2,3 ,
徐磊2,3 ,
高玉尧2,3 ,
安东升2,3
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姚艳丽2,3 ,
胡小文2,3 ,
徐磊2,3 ,
高玉尧2,3 ,
安东升2,3
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 12 篇
收稿日期: 2017年07月11日 接受日期: 2017年09月16日 发表日期: 2018年05月21日
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摘 要
割手密抗逆基因资源的挖掘是甘蔗抗逆育种的重要工作任务。本研究以前期转录组测序得到的割手密REMO基因cDNA序列为探针，对Genbank中的EST数据库进行同源检索，发现高粱REMO基因(XM 002465954.1)与其具有极高的相似性(94%)。利用高粱REMO基因(XM 002465954.1)设计同源引物，后经PCR、分子克隆、序列分析验证成功分离了7个割手密REMO基因cDNA序列(SsREMO-1a~g, GeneBank登录号为MF095088-MF095094)。7条序列全长均为738 bp，5’非翻译区(UTR)长度78 bp，3’UTR长度为96 bp，包含一个564 bp的开放读码框，编码187个氨基酸。分析表明此蛋白序列具有REMO保守结构域。SsREMO-1a~g的相似性在98.9%~99.7%之间，存在14个单核苷酸多态性(SNP)位点，4个氨基酸变异位点，蛋白相似性在98.4%~100%之间。SsREMO-1蛋白序列与高粱、水稻、玉米等物种具有较高的同源性，可分为两个亚类。
关键词
割手密； REMO基因； 基因克隆； 变异分析
