研究报告/Research Report
柿树的EST-SSR标记开发 
王静1,2,3,4 
,
颜芹1,2,3,4 ,
王洁5 ,
黄月娇1,2,3,4 ,
闫晓雨1,2,3,4 ,
李佳慧1,2,3,4 ,
张丽1,2,3,4 ,
张萌1,2,3,4 ,
薄文浩1,2,3,4 
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颜芹1,2,3,4 ,
王洁5 ,
黄月娇1,2,3,4 ,
闫晓雨1,2,3,4 ,
李佳慧1,2,3,4 ,
张丽1,2,3,4 ,
张萌1,2,3,4 ,
薄文浩1,2,3,4
1北京林业大学计算生物学中心, 北京, 100083; 2北京林业大学, 林木育种国家工程实验室, 北京, 1050083; 3北京林业大学,林木花卉遗传育种教育部重点实验室, 北京, 100083; 4北京林业大学生物科学与技术学院, 北京, 100083; 5 山东省果树研究所, 山东, 271000
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 22 篇
收稿日期: 2017年06月02日 接受日期: 2017年06月07日 发表日期: 2018年02月23日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 22 篇
收稿日期: 2017年06月02日 接受日期: 2017年06月07日 发表日期: 2018年02月23日
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摘 要
柿树是中国重要经济树种。为了开发柿树SSR标记，从NCBI的EST数据库中共下载14 198条柿树EST序列，经过去冗余处理和SSR位点搜索，共筛选到1 320条EST-SSR序列可以用于引物设计。实验中随机选取了314对引物进行合成和筛选，共有127对引物成功扩增出多态性扩增条带，加上从已发表的柿子SSR引物中筛选出的14对多态性较高的引物，共利用141对引物，通过SSR分型检测数据分析，获得了可用于模型分析的异源六倍体柿树全同胞家系共141套分子标记的数据。柿树是一种六倍体树种，多态性标记的开发在柿树的遗传学研究和分子育种上将会有众多的应用，能够促进正对六倍体物种的遗传分析模型的开发，也将对一系列重要的六倍体农作物(小麦, 甘蔗, 棉花等)的研究有推动作用。
关键词
柿树；EST-SSR；引物开发
