李焕苓¹ , 田婉莹¹ , 王家保¹ , 张新春¹ , 张蕾² , 王果¹ , 王树军¹ , 孙进华^1*

1中国热带农业科学院环境与植物保护研究所, 海口, 571101; 2中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所, 儋州, 571737
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《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2017年05月05日    接受日期: 2017年07月31日    发表日期: 2018年03月10日

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为了解232份主要来自海南的栽培荔枝、半野生荔枝和野生荔枝的遗传多样性及其演化地位，摸清荔枝品种中存在的同名异物和同物异名问题；本研究依据获得的荔枝EST序列和基因组序列开发了一批SSR和InDel标记，利用这些标记对232份荔枝种质资源进行了遗传多样性研究；取6个荔枝品种DNA为模板，筛选出18对SSR引物和12对Indel引物应用于遗传多样性研究，检测到基因位点141个，等位基因变异数范围为2-11个，平均4.70个，多态性位点为139个，多态性位点比率是98.58%。UPGMA聚类分析发现，232份荔枝种质资源的遗传相似系数是0.66-1.00；发现SSR引物的多态性大于InDel引物；在遗传相似系数为0.76处，供试材料分为15类，多数来自海南的荔枝资源能一起聚类，海南11份野生荔枝资源分别聚类在5个类群中，说明海南野生荔枝资源的遗传多样性较丰富。研究将为进一步开展荔枝遗传改良和育种提供依据。

荔枝；SSR；InDel；遗传多样性