赵梅 , 赵芳 , 彭丽云 , 潘君飞 , 张梓浩 , 赖钟雄^* , 刘生财^*

福建农林大学园艺植物生物工程研究所, 福州, 350002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2017年05月03日    接受日期: 2017年05月27日    发表日期: 2018年08月01日

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推荐引用：

Zhao M., Zhao F., Peng L.Y., Pan J.F., Zhang Z.H., Lai Z.X., and Liu S.C., 2018, Cloning and bioinformatics analysis of
WRKY13 gene in Amaranthus tricolor L., Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(12): 3830-3835 (赵梅, 赵芳, 彭丽云,潘君飞, 张梓浩, 赖钟雄, 刘生财, 2018, 苋菜 WRKY13 基因克隆与生物信息学分析, 分子植物育种, 16(12): 3830-3835)

以苋菜试管苗为材料，利用实验室构建的苋菜转录组数据库，筛选出 WRKY13 基因 cDNA 序列，对其开放阅读框(ORF)进行克隆验证和生物信息学分析。结果表明，WRKY13 基因 ORF 长度为 675bp，编码 224个氨基酸。通过生物信息学预测，该蛋白属于疏水性蛋白，有 44 个氨基酸位点存在磷酸化修饰；是 WRKY 蛋白超级家族(WRKY superfamily)的一个成员，存在 1 个 WRKY 结合位点；其二级结构由无规则卷曲结构、茁 折叠组成和 琢 螺旋；蛋白系统进化树分析表明苋菜 WRKY13 蛋白独立形成一个分支，但与拟南芥、芜菁、烟草、葡萄聚类到一起，说明 WRKY13 蛋白在生物进化过程中还是比较保守的。本研究获得了苋菜 WRKY13 基因完整 ORF，这为将来深入研究苋菜 WRKY13 基因功能提供了科学依据，也为研究其调控甜菜红素代谢过程的影响提供参考。

苋菜；WRKY13； ORF； 克隆； 生物信息学