利用Insertion/Deletion (InDel)分子标记检测玉米互交种混杂的原理及应用  

葛敏1* , 蒋璐1* , 张晓林2 , 赵涵1 , 张体付1
1 江苏省农业科学院农业生物技术研究所, 江苏省农业生物学重点实验室, 南京, 210014
2 南京农业大学, 南京, 210095
*同等贡献作者
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 6 篇   doi: 10.3969/mpb.011.000037
收稿日期: 2012年09月04日    接受日期: 2012年09月23日    发表日期: 2012年11月07日
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摘 要

尽管分子标记广泛用于玉米品种纯度鉴定,但由于互交种基因组具有相同的基因,现有的分子标记技术尚不能对互交种的混杂进行有效判定。本研究基于玉米互交种胚乳等位基因二倍剂量关系,利用Insertion/Deletion (InDel)标记在PCR指数扩增期对等位基因扩增相对量的观察值与理论值进行统计分析,通过概率对互交种进行判定。经过筛选,亲本B73、Mo17间存在共显性差异的8个InDel标记中,5个标记的PCR扩增质量满足互交种样本(正交种:B73×Mo17,反交种:Mo17×B73)的鉴定要求。这些标记以不同的循环数进行PCR扩增,发现37个循环是处于指数扩增期的最佳鉴定时期。同一标记在每个样本中以37个循环数进行3次扩增重复,统计分析发现:不同标记在杂交种叶片DNA中等位基因扩增相对量与理论比1的统计概率值从6.50E-08到1.000不等,证实标记在等位基因间的扩增效率并不完全一致。对互交种胚乳等位基因扩增相对量进行卡方测验,4个InDel标记能够对互交种样本进行准确区分,所得概率符合判定标准。标记110仅能准确判定正交种,对反交种样本的统计概率不满足反交种判定的概率标准。结果显示,该分子标记方法可成功用于玉米互交种的判定。

关键词
插入/缺失;分子标记;正交;反交;纯度鉴定;玉米
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《分子植物育种》印刷版
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