研究报告/ Research Report

大麦HD-Zip IV基因家族的生物信息学分析  

熊辉岩 , 张超 , 多杰措 , 周武 , 段瑞君
1青海大学农牧学院, 西宁, 810016 2青海大学生态环境工程学院, 西宁, 810016
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2017年04月28日    接受日期: 2017年05月10日    发表日期: 2018年01月25日
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摘 要

同源异型域-亮氨酸拉链第IV蛋白家族(Homeodomain-leucine Zipper IV, HD-Zip IV)是HD-Zip转录因子家族的第四亚族,为植物特有的一类转录因子蛋白,在植物的表皮发育、花色素苷积累、脂质转运以及角质层的生物合成等发挥了重要作用。利用大麦全基因组数据库,获得大麦HD-Zip IV基因多肽序列并鉴定了8条HD-Zip IV蛋白序列,对这些成员的染色体分布、蛋白质结构、基因结构与进化、转录表达等进行了预测和分析。结果表明,除了第3、4号染色体外,其他5条染色体上均有分布。理化性质和结构分析表明,大麦与其他物种的HD-Zip IV序列基本相似,但有细微差别。进化分析表明大麦HD-Zip IV基因可能在单、双子叶植物分化后发生多样化并扩大形成了该基因家族。大麦HD-Zip IV基因在生殖器官中特异表达,推测与大麦籽粒的生长与发育有关。本研究为研究大麦HD-Zip IV基因家族的生物学功能提供理论支持。

关键词
大麦;HD-Zip IV;基因家族;生物信息学
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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