研究报告/Research Report

绿豆生长素响应因子基因家族序列特征及分子进化  

王彩萍1 , 王丽2 , 宋敏2 , 刘荣华2 , 孙朝霞2 , 侯思宇2,3*
1山西省农业科学院经济作物研究所, 汾阳, 032200; 2山西农业大学, 农业生物工程研究所, 太谷, 030801; 3山西农业大学, 特色杂粮基因资源挖掘与种质创新山西省重点实验室, 太谷, 030801
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2017年04月28日    接受日期: 2017年05月09日    发表日期: 2018年01月25日
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摘要

绿豆种子萌发率严重影响和制约其田间产量,研究利用与绿豆种子萌发相关的基因资源具有十分重要的意义。本研究拟通过查询绿豆转录组数据库,分离包含完整ORF的生长素响应因子(ARF)基因家族成员,对比分析该家族成员的蛋白保守结构域,基于氨基酸序列同源性构建系统进化树。结果表明:分离到22个包含完整ORF的ARF基因,其核苷酸序列长度范围为876~3 624 bp,其编码氨基酸序列长度的范围为237~761 aa。其中仅有4个ARF基因包含保守的B3 DNA结合结构域、Auxin响应因子和AUX/IAA家族蛋白结构域,其他基因存在1~2个保守结构域的缺失。系统进化树结果显示,绿豆22个ARF基因与拟南芥12个ARF基因共划分为3大类,9个亚类。这些结果为进一步揭示绿豆ARF基因功能多样性,同时为将来遗传工程改良绿豆品种提供理论参考。

关键词
绿豆;生长素响应因子;基因家族;系统进化

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《分子植物育种》印刷版
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