研究报告 / Research Report

马尾松PmSnRK2.3基因的克隆与实时荧光定量表达分析  

韦蔷1 , 季子钧2 , 宫铭1 , 黄昊1 , 陈佩珍1 , 吴晓刚1 , 季孔庶1
1林木遗传与生物技术省部共建教育部重点试验室, 南京林业大学南方现代林业协同创新中心, 南京, 210037; 2资源与环境学院, 安徽农业大学, 合肥, 230036
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2017年04月14日    接受日期: 2017年05月13日    发表日期: 2018年02月01日
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摘要

蔗糖非发酵相关蛋白激酶在植物胁迫应答过程中起着重要的作用。本研究以拟南芥SnRK2基因家族为材料,检索本实验室马尾松转录组数据库,获得一条马尾松SnRK2基因,经同源比对命名其为PmSnRK2.3。PmSnRK2.3基因的ORF全长1 089 bp,编码362个氨基酸,蛋白相对分子质量为40.86 kD,理论等电点(pI)为4.96,总亲水性平均数为-0.330,预测该蛋白为亲水蛋白。生物信息学研究表明,PmSnRK2.3具有典型的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶保守结构域和多处磷酸化位点。另外,实时荧光定量结果表明SnRK2.3基因在马尾松中的表达存在组织差异性,在叶中表达量最高,根中最低;经过ABA和PEG胁迫后的马尾松幼苗PmSnRK2.3基因表达量总体高于对照组,并在24 h内表现出一定的波动。研究表明,SnRK2.3基因在出现干旱和ABA胁迫时表达量上调,很可能在马尾松抗旱性能方面起着一定的作用。

关键词
马尾松;PmSnRK2.3; 基因克隆; 生物信息学分析; 实时荧光定量

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《分子植物育种》印刷版
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