研究报告

基于荧光标记的茶树花转录组序列 SSR 标记开发  

邓少春 , 陈林波 , 田易萍 , 陈春林 , 徐丕忠 , 李朝云 , 梁名志 *
云南省农业科学院茶叶研究所, 云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心, 云南省茶学重点实验室, 勐海, 666201
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 20 篇   
收稿日期: 2017年04月06日    接受日期: 2017年09月29日    发表日期: 2019年01月04日
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摘要

本研究对 204 199 条茶树花转录组 Unigenes 进行 SSR 简单重复序列的查找,得到含有 SSR 的序列60 581 个,出现频率为 29.67%EST-SSR 重复类型以单核苷酸和二核苷酸为主,占总 SSR 比例的 85.69%,其中主要重复基序类型为单核苷酸,占总 SSR 47.97%A/T 重复类型出现最多。采用荧光标记 PCR 技术对设计合成的 100 SSR 引物进行引物筛选,其中有 28 对引物扩增条带清晰、多态性好,在 4 个品种的茶树花中得到有效性验证。结果表明,茶树花转录组的 SSR 标记开发是可行的,这些 EST-SSR 的开发对茶树花遗传多样性分析、分子育种和开发茶树不育相关的 SSR 标记等具有重要意义。

关键词
茶树花;转录组;SSR;荧光标记

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《分子植物育种》印刷版
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