研究报告/ Research Report

苹果AQPs生物信息学分析及2个砧木AQPs对干旱胁迫的响应  

冉应龙 , 毛娟 , 左存武 , 马宗桓 , 李文芳 , 姜雪峰 , 马啸 , 锁瑞妮 , 苏瑞 , 陈佰鸿
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2017 年, 第 15 卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2017年03月16日    接受日期: 2017年04月06日    发表日期: 2017年04月24日
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摘要

为了解苹果水通道蛋白基因家族(AQPs)的生物信息学特征及苹果砧木对干旱胁迫的响应特点,对苹果AQPs进行系统进化、基因结构等生物信息学分析,并利用荧光定量PCR测定干旱胁迫下M26和山定子AQPs的表达水平。研究表明,苹果AQPs 30家族成员个可分为3个亚族,含2~7个外显子,分别定位于苹果的15条染色体上,2、4号染色体无AQPs存在;1、9号染色体上分别定位5、4个基因,其余定位1~3个不等。AQPs氨基酸序列含NPA特征序列及TGINPARSI/FGAAI/VI、SGXHXNPAVT及GGGANXXXXGY保守基序;跨膜区域数量为4~7不等。轻度干旱胁迫下,M26叶片中MdPIP24的表达量最高,为11.0298;根中Mdδ-TIP表达量最高,为17.1480。山定子叶片中MdNIP42表达量最高(18.4643),根中MdTIP13表达量最高(5.2172)。中度干旱胁迫下,M26叶片中MdPIP24MdNIP12MdNIP41表达量分别上调34.63%、35.23%和89.42%;根中MdTIP51Mdδ-TIPMdβ-TIP表达量分别下调46.04%、50.12%和52.48%。山定子叶片中MdNIP51MdNIP61表达量分别上调16.8%和27.47%,MdNIP12下调37.73%;根中MdTIP13MdTIP22MdTIP51表达量分别上调29.92%、37.15%和70.29%。苹果AQPs基因结构和氨基酸序列具有较高的保守性。干旱胁迫下各AQPs基因在山定子和M26中的表达量存在显著差异,部分AQPs只在叶片或根部表达,存在组织差异性现象。

关键词
苹果;AQPs;生物信息学分析;qRT-PCR;砧木

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《分子植物育种》印刷版
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