李丽丽 , 曾卫军 , 李艳红 , 葛风伟 , 卢函 , 雷维 , 杜钰 , 谢红桃 , 赵和平 , 赵惠新

1新疆特殊环境物种保护与调控生物学实验室, 乌鲁木齐, 830054; 2北京师范大学生命科学学院, 抗性基因资源与分子发育北京市重点实验室, 北京, 100875
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《分子植物育种》印刷版, 2017 年, 第 15 卷, 第 20 篇   
收稿日期: 2017年03月16日    接受日期: 2017年04月05日    发表日期: 2017年04月28日

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以耐受低温萌发停滞期的种子为实验组，以低温萌发停滞期的种子为对照组，对独行菜(Lepidium apetalum Willd.)种子转录组进行了高通量测序。基于测序数据库资源，本文对独行菜GRAS类转录因子进行了分析，除去冗余，发现独行菜种子共有GRAS家族270个成员。其中138个相对于低温萌发停滞组，在耐受低温萌发的独行菜种子中上调表达，128个下调表达，4个表达水平无差异。进一步选择了一个极显著上调表达的GRAS基因片段，结合同源序列克隆法、采用RT-PCR技术克隆获得该GRAS基因cDNA序列，全长1633bp。通过BLastn同源序列比对分析表明，该全长基因与拟南芥GRAS基因家族SCL18全长基因一致性最高，达到96%，本文将其命名为LaSCL18（GenBank登录号KY466159）。生物信息学分析表明，该cDNA序列编码一个由435个氨基酸组成的开放阅读框、编码蛋白分子质量139.883KD，该蛋白理论等电点为4.97、具有GRAS转录因子家族特有的保守结构域、不具有跨膜区和DNA结合位点，是一个水溶性较好的球状蛋白。实时荧光定量PCR分析表明，独行菜幼苗在低温胁迫处理后LaSCL18基因表达量迅速显著升高，初步推测LaSCL18基因表达与独行菜幼苗耐受低温有关。

独行菜；GRAS转录因子；LaSCL18；表达分析；低温耐受