研究报告

番茄生长素响应因子基因家族的鉴定和生物信息学分析  

李菲* , 何小红 , 李欲轲 , 乙引*
贵州师范大学生命科学学院, 贵州省植物生理与发育调控重点实验室, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2017年02月28日    接受日期: 2018年04月26日    发表日期: 2019年01月11日
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摘要

ARFs (auxin response factors)是植物生长素信号感知和信号传导途径非常关键的转录因子,在植物发育、生物、非生物胁迫和生长趋向性的响应等方面起到极端重要的作用。对番茄全基因组 ARFs 基因家族成员进行筛选、鉴定和生物信息学分析,具有极其重要的意义。番茄基因组中共有 22 ARFs 基因。9 个番茄 ARFs 基因由 600~700 个氨基酸编码,是番茄 ARFs 基因大小比较集中的区间。72.7% (16/22)的番茄 ARFs基因等电点小于 7,在 pH 5.39~6.84 的区间内。绝大多数番茄 ARFs 基因结构较为复杂,有数十个内含子。不过有一个番茄 ARFs 进化分枝,内含子较少。番茄和拟南芥 ARFs 全部基因的系统进化分析表明,番茄缺少拟南芥 1 号染色体上 7 ARFs 基因组成的一个进化分枝。番茄 ARFs 基因表达表现出显著的组织特异性和随发育阶段的变化。

关键词
番茄;生长素响应因子;基因家族;系统进化;信号传导

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《分子植物育种》印刷版
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