研究报告/Research Report

广西地方稻种资源核心种质红色种皮全基因组关联分析及鉴定两个新的Rc等位基因  

杨行海 , 农保选 , 夏秀忠 , 张宗琼 , 曾宇 , 刘开强 , 邓国富 , 李丹婷
广西农业科学院水稻研究所, 广西水稻遗传育种重点实验室, 南宁, 530007
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14 卷, 第 76 篇   doi: 10.5376/..00.
收稿日期: 2016年10月10日    接受日期: 2016年11月01日    发表日期: 2016年11月03日
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摘要

稻米种皮颜色可以分为白,红,黑等。在红色稻米种皮中富含原花青素,其具有抗氧化活性,有利于人体健康。本研究以419份广西地方稻种资源核心种质为实验材料,利用全基因组关联分析验证了控制水稻红色种皮的基因Rc。利用InDel标记HM1对97份红色种皮材料的DNA进行PCR,发现C323和C139属于第7外显子有14 bp缺失的红色种皮品种。然后,我们利用Sanger测序技术对这两个自然突变品种的Rc基因进行外显子测序,分析结果表明RcC139RcC323属于2种不同的Rc等位基因类型。

关键词
水稻;红色种皮;全基因组关联分析;等位基因

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《分子植物育种》印刷版
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