研究报告/Research Report

3种分子标记在分析茶树种质资源遗传多样性上的比较  

张羽1* , 李佼2 , 席彦军2 , 李秀峰2 , 徐凯明3
1陕西理工大学生物科学与工程学院, 汉中, 723000;
2陕西省汉中市农业科学研究所, 汉中, 723000;
3陕西省汉中市职业技术学院, 汉中, 723000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14 卷, 第 13 篇   
收稿日期: 2016年08月29日    接受日期: 2016年09月26日    发表日期: 2016年10月10日
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摘要

本研究的目的是比较EST-SSRSRAPSCoT标记在茶树资源研究中的可应用性,为茶树分子标记的选择与优化提供依据。本研究用6份有代表性的茶树资源,从中筛选出扩增条带清晰、多态性高的EST-SSR标记40对、SRAP标记40对、SCoT标记38个,对50份茶树材料的遗传多样性进行分析,重点比较了这3种分子标记的多态性条带比率(PPB)、多态性信息含量(PIC)位点平均信息量(Ibav)、有效多元比率(EMR)、引物解析强度(Rp)、标记指数(MI)等方面的差异。40EST-SSR引物共检测到320个等位位点,平均为8.00个,引物PPBPICEMRIbavRpMI值分别 94.06%0.857.530.564.484.2240SRAP引物共检测到336个等位位点,平均为8.40个,引物PPBPICEMRIbavRpMI值分别为89.88%0.777.550.615.114.6138SCoT引物共检测到439个等位位点,平均为11.55个,引物PPBPICEMRIbavRpMI值分别为90.66%0.7910.470.586.716.073种标记体系检测到的平均等位位点、EMRRpMI值都表现为SCoT最高,其次为SRAP,再次为EST-SSR,而EST-SSRPPBPIC值最高,其次为SCoT,再次为SRAPSCoT具有较高的标记效率,而EST-SSR标记具有丰富的位点多态信息。

关键词
茶树;EST-SSR; SRAP;SCOT,;多样性

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《分子植物育种》印刷版
• 第 14 卷
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