研究报告/Research Report

蓖麻RcNHX2基因的克隆与生物信息学分析  

冯紫洲1 , 耿学军2 , 李平2 , 张继星2,3 , 陈永胜2,3 , 霍红雁2 , 冀照君2 , 穆莎茉莉2,3 , 丛娇娇2 , 李惠根2
1内蒙古民族大学农学院, 通辽, 028000; 2内蒙古民族大学生命科学学院, 通辽, 028000; 3内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心, 内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室, 内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心, 通辽, 028000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14 卷, 第 62 篇   
收稿日期: 2016年08月26日    接受日期: 2016年08月31日    发表日期: 2016年08月31日
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摘要

液泡膜型钠氢逆向转运蛋白 (Tonoplast Na+/H+ antiporters, NHX)在植物耐盐方面具有重要意义。本研究利用RACE方法克隆了蓖麻RcNHX2基因的3'端和5'端片段。最后设计全长引物获得蓖麻RcNHX2全长序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,蓖麻液泡膜型钠氢逆向转运蛋白基因的cDNA完整的开放阅读框序列为1 626 bp,推测其可编码541个氨基酸;含有典型的液泡膜型钠氢逆向转运蛋白典型的Na+/H+交换泵(50NES52)和氨氯吡嗪咪的结合位点(84LFFIYLLPPI93);存在12个跨膜结构域,属于跨膜蛋白;预测其定位于细胞质膜和液泡膜及内质网膜。

关键词
蓖麻;液泡膜型钠氢逆向转运蛋白;基因克隆;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
• 第 14 卷
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