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《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14 卷, 第 0 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日

采用新一代高通量测序技术Illumina HiSeq 2000对铁皮石斛（Dendrobium officinale）转录组进行测序，共获得 11153295000nt数据。对reads进行序列组装，共获得121596个单基因簇（ Unigene），平均长度660bp，序列信息达到了40.16 Mb。生物信息学数据库比对表明，Unigene功能注释到NR，NT，Swiss-Prot，KEGG，COG，GO库为52345个。铁皮石斛转录组中的Unigene根据GO功能大致可分为细胞组分、分子功能和生物学过程3大类57个分支，其中有大量的 Unigene 与代谢进程、结合活性、催化活性和细胞进程相关。将 Unigene 与 COG 数据库进行比对，根据其功能大致可分为25类。 KEGG 数据库作为参考，依据代谢途径可将 Unigene 定位到 128个代谢途径分支。 SSR 位点查找发现，从Unigene 中共找到9892个SSR 位点。 SSR 不同重复基序类型中，出现频率最高的为 AG/CT，其次是 AAG/CTT、 CCG/CGG 和 AGG/CCT。