研究报告/Research Report

大赖草ISSR-PCR反应体系的优化及引物筛选  

代培红1 , 周贵玲2 , 苏秀娟1 , 李月1 , 刘超1 , 吾买尔夏提·塔汉2
1新疆农业大学农学院, 乌鲁木齐, 830052;
2 新疆农业大学草业与环境科学学院, 乌鲁木齐, 830052
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14 卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2016年04月14日    接受日期: 2016年05月11日    发表日期: 2016年05月13日
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摘要

为了建立大赖草最佳的ISSR-PCR反应体系,以大赖草基因组DNA为模板,利用正交试验设计和单因子实验相结合的方法,对影响大赖草ISSR-PCR反应的各个因素( 模板、dNTPs及引物等)进行优化试验,同时筛选出扩增条带清晰、稳定性好的ISSR引物并确定其退火温度。结果表明,大赖草的ISSR-PCR的优化反应体系最终确定为:在25 μL的反应体系中,Mg2+2.5 mmol/L、dNTPs 0.3 mmol/L、引物0.4 µmol/L、DNA 模板50 ng/µl 和Taq DNA 聚合酶1.0 U。体系验证试验表明该体系稳定、可靠,另外筛选出10条较好的引物,可用于后续的大赖草遗传多样性分析及亲缘关系分析、基因定位与克隆、连锁图谱构建等方面的研究,并对其它近缘作物有指导意义。

关键词
大赖草;ISSR-PCR;单因子试验;正交设计;引物筛选

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《分子植物育种》印刷版
• 第 14 卷
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