何平 , 李林光 , 王海波 , 李慧峰 , 常源升

山东省果树研究所, 泰安, 271000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14 卷, 第 29 篇   
收稿日期: 2016年03月28日    接受日期: 2016年05月29日    发表日期: 2016年11月28日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

推荐引用：

He P., Li L.G., Wang H.B., Li H.F., and Chang Y.S., 2016, Analysis on SSR information in transcriptome and development of molecular markers in peach (Prunus persica [L.] Batsch), Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 14(11): 3130-3135 (何平, 李林光, 王海波, 李慧峰, 常源升, 2016, 桃(Prunus persica [L.] Batsch)转录组SSR信息分析及其分子标记开发, 分子植物育种, 14(11): 3130-3135)

利用MISA软件筛选桃(Prunus persica [L.] Batsch)转录组数据，获得的109 248条Unigene，检测出24 102个SSR位点，分布于22 689条Unigene中，出现频率为20.76%。SSRs位点中主导类型是以AG/CT(占总SSRs的18.70%)为主的二核苷酸重复，占总SSRs的33%；其次是三核苷酸重复，出现频率为27%；四核苷酸重复，占总SSRs的25%。利用Primer 5共设计出9 657对SSR引物。随机选择50对引物进行PCR扩增，其中20对扩增出清晰可重复的条带，并且在同属材料(苹果试材)中也能获得理想结果，引物多态性检测发现，在15份桃试材中，10对引物具有多态性，利用UPGMA作图，可将15个桃材料很好区分。结果表明，桃转录组测序产生的Unigene是开发SSR标记的有效信息，为SSR标记在桃的遗传分析上提供可靠的标记选择。

桃；转录组；SSR；引物；多态性