研究报告/Research Report

小桐子SnRK2基因家族的全基因组鉴定及特征分析  

王海波1,2
1曲靖师范学院, 云南高原生物资源保护与利用研究中心, 生物资源与食品工程学院, 曲靖, 655011;
2曲靖师范学院, 云南省高校云贵高原动植物遗传多样性及生态适应性进化重点实验室, 曲靖, 655011
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14 卷, 第 32 篇   
收稿日期: 2016年03月12日    接受日期: 2016年05月09日    发表日期: 2016年06月20日
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摘要

蔗糖非发酵-1型相关蛋白激酶2 (Sucrose non-fermenting-1 related protein kinase 2, SnRK2)属植物特有的一类Ser/Thr类蛋白激酶,参与植物体内多种信号转导途径及逆境胁迫的应答。基于小桐子基因组数据,利用生物信息学的方法鉴定到7个小桐子SnRK2基因家族成员,并对其从系统进化、理化性质、基因结构及顺式作用元件等进行了分析。结果表明,小桐子SnRK2基因在进化上较为保守,并聚类为3个亚家族。基因结构包含9~10个外显子,编码的蛋白序列都鉴定到典型的激酶结构域以及C末端酸性补丁区域。同时,在SnRK2基因上游调控区域都鉴定到多个激素与逆境应答元件。表达分析显示,SnRK2.1SnRK2.2在低温处理下上调表达显著,经过干旱处理,7个小桐子SnRK2基因在叶中都上调表达,而SnRK2.1SnRK2.2SnRK2.5上调表达量达到极显著水平(p<0.01)。本研究为进一步的克隆小桐子SnRK2基因以及研究其在信号转导与激素、逆境应答中的功能提供了参考。

关键词
小桐子;SnRK2;蛋白激酶;基因组;序列特征分析

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《分子植物育种》印刷版
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