研究报告/Research Report

杉木等5种针叶树叶绿体密码子偏好性分析  

郑薇玮1,2 , 陈金慧1 , 郝兆东1 , 施季森1
1 南京林业大学林学院, 林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室, 南京, 210037
2 福建江夏学院电子信息科学学院, 福州, 350108
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2016年01月11日    接受日期: 2016年02月15日    发表日期: 2016年04月25日
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摘要

 研究植物叶绿体基因的编码特点,对指导叶绿体基因工程的研究和遗传转化设计,提高外源基因在目的物种中的高效表达具有重要作用。本文综合使用多种生物信息学分析工具分析杉木、台湾肖楠、日本柳杉、秃杉,以及台湾杉等5种针叶树的叶绿体蛋白编码基因,得到,叶绿体蛋白编码基因的总碱基的构成在5种针叶树中差异不明显,均以A含量为最高;密码子末位碱基构成亦无明显差别;其RSCU值揭示了这5种针叶树不同的密码子偏好性。

关键词
杉木;针叶树;叶绿体基因组;密码子偏好性;聚类分析

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《分子植物育种》印刷版
• 第 14 卷
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