研究报告

森林草莓B-box基因家族全基因组序列鉴定及表达分析  

叶云天 , 娄可飞 , 王熙然 , 刘勇强 , 陈清 , 汤浩茹
四川农业大学园艺学院, 成都, 611130
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14 卷, 第 20 篇   doi: 10.5376/..00.
收稿日期: 2015年12月07日    接受日期: 2015年12月30日    发表日期: 2016年01月28日
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摘要
植物B-box基因参与植物形态建成、花器官发育以及响应逆境胁迫过程中的多种生命活动的并具有重要作用,草莓是重要的经济果树作物,然而对草莓B-box家族了解较少。为了研究草莓B-box基因家族成员及其在花器官发育过程中的表达情况,本研究利用计算生物学的方法从全基因组水平鉴定森林草莓(Fragariavesca)B-box基因家族成员,并对家族成员的蛋白质特征、基因组分布、内含子个数以及基因表达进行分析。结果表明,森林草莓中至少存在21个B-box基因家族成员,分布在6条染色体上,基因内含子个数1~5个。基于蛋白质模体组成与蛋白质序列的分析将整个家族分为五个亚家族。14个基因家族成员以5种表达模式参与雄蕊器官发育进程。研究结果表明:草莓B-box基因家族的5个亚家族经过模体复制和删除事件进化而来,并参与花器官发育过程。试验结果将为在草莓中进一步研究该基因家族成员功能提供参考。
关键词
草莓;基因家族;生物信息学;B-box

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《分子植物育种》印刷版
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