研究报告

基于EST-SSR标记的云南黄瓜种质资源遗传多样性和亲缘关系分析  

李翔 , 张颖 , 许俊强 , 宋婷 , 李文璐 , 董玉梅 , 张应华
云南农业大学云南省滇台特色农业产业化工程研究中心, 昆明, 650201
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14 卷, 第 18 篇   doi: 10.5376/mpbopa.2016.14.
收稿日期: 2015年12月07日    接受日期: 2015年12月28日    发表日期: 2016年01月28日
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摘要
本研究从87对黄瓜EST-SSR引物中筛选出64对多态性引物,对39份云南地方黄瓜材料进行了遗传多样性和亲缘关系分析,281个观察等位基因被检测,平均检测每对引物4.40个,平均Shannon’s信息指数为1.08。PIC在0.07~0.84之间,平均为0.55,Ho在0.05~0.92之间,均值为0.56,表明云南地方黄瓜种质资源遗传多样性较丰富。采用非加权类平均法(UPGMA)聚类,聚类分析表明39份云南地方黄瓜材料,当SM为0.665(L1)时,分为3大类群;当SM为0.738(L2)时,分为5个亚类群。二维图主坐标分析方法将其分为4大类群,而三维图主坐标分析方法分为6个亚类群。聚类分析和主坐标分析所获得结果基本一致,三维图主坐标更能较为真实的反映39个云南地方黄瓜材料间的亲缘关系,研究结果可为黄瓜种质资源保存和新品种选育提供依据。
关键词
黄瓜;聚类分析;主坐标分析;种质资源

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《分子植物育种》印刷版
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