研究报告

细叶桉早期生长的SSR标记关联分析  

宋志姣 , 翁启杰 , 周长品 , 李发根 , 李梅 , 杨合宇 , 卢万鸿 , 罗建中 , 甘四明
1林木遗传育种国家重点实验室, 北京, 100093; 2热带林业研究实验室, 中国林业科学研究院热带林业研究所, 广州, 510520; 3国家林业局桉树研究开发中心, 湛江, 524022
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14 卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2015年10月07日    接受日期: 2015年11月02日    发表日期: 2016年01月13日
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摘要

本研究基于巨桉全基因组的108个SSR标记(44个基因组SSRs和64个EST-SSRs),通过对细叶桉9个群体的78株样品的初步关联分析和242株样品的关联验证,利用一般线性模型和混合线性模型共检测到与细叶桉9月生树高(H9)、30月生树高(H30)和30月生胸径(D30)显著关联的标记分别为2个、3个和4个。除1个标记(Embra227)同时与H30D30显著关联外,不同性状的关联标记均不相同。单个标记对表型变异的解释率为10.3%~34.6%。与H9H30D30关联的最大增效等位片段的效应值分别为0.67 m、1.64 m和1.97 cm,最大减效等位片段的效应值分别为-0.72 m、-1.94 m和-1.87 cm。H9H30D30的平均增效效应最大的关联标记分别为EUCeSSR1070 (0.41 m、26.8%)、EUCeSSR1136 (0.73 cm、12.3%)和EUCeSSR906 (1.48 cm、25.3%),平均减效效应最大的关联标记分别为EUCeSSR1070 (-0.25 m、16.3%)、Embra227 (-1.06 m、17.2%)和Embra227 (-1.15 cm、17.7%)。这为桉树分子育种提供了有潜力的标记资源。

关键词
细叶桉(Eucalyptus tereticornis);SSR标记;早期生长;关联分析

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《分子植物育种》印刷版
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