研究报告

台湾金线莲转录组特性研究  

姜福星1 , 魏丕伟2 , 寇亚平2 , 江欣燕1 , 贾茵1 , 陈其兵1*
1四川农业大学园林研究所, 成都, 611130; 2四川理工学院生物工程学院, 自贡, 643000; 3中国农业大学园艺学院, 北京, 10083
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2015年10月06日    接受日期: 2015年11月17日    发表日期: 2015年12月18日
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摘要

台湾金线莲(Anoectochilus formosanus)是我国传统的珍贵药材,素有金草神药等美称,具有很高的药用价值、观赏价值和经济价值。台湾金线莲的全草入药,且挥发油中也含有多种药用成份。本研究采用Illumina HiSeq 2000高通量测序技术,对其全草进行转录组分析,共获得原始数据5.3 Gb,有效数据4.4 GbUnigene173 513条,Unigene平均长度为680 bp通过与其他核酸、蛋白质数据库的Blast比对,58 451条得到Nr功能注释,21 386条得到COG功能分析,45 812GO功能解释。KEGG代谢途径研究发现,130Unigene与黄酮类物质有关,114Unigene与生物碱有关,441Unigene与萜类物质有关。搜索发现21 195个微卫星位点,其中单核苷酸最多有13 126个,占61.93%,其次分别是三核苷酸和二核苷酸,分别占17.4%15.61%

关键词
台湾金线莲;转录组分析;药用活性成份;微卫星标记

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《分子植物育种》印刷版
• 第 13 卷
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