1四川农业大学生命科学学院, 雅安, 625014
2攀枝花学院生物与化学工程学院, 攀枝花, 617000
作者
通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 13 篇 doi: 10.5376/..00.
收稿日期: 2015年09月08日 接受日期: 2015年09月21日 发表日期: 2015年12月16日
2攀枝花学院生物与化学工程学院, 攀枝花, 617000
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《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 13 篇 doi: 10.5376/..00.
收稿日期: 2015年09月08日 接受日期: 2015年09月21日 发表日期: 2015年12月16日
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摘要
本研究以道地药材金龙胆草叶片为研究对象,利用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术构建了金龙胆草转录组数据库,获得了42 903 527条Reads数据,通过与Nr、GO、COG、KOG、KEGG等数据库比对,最终获得了38 199个具有注释信息的Unigenes。其中以KEGG数据库为参考,依据代谢通路将Unigenes分成117类,包括萜类骨干合成、二萜类合成、黄酮类化合物生物合成及聚糖生物合成等路径,分别有99,23,161及70个Unigenes映射到上述途径,这些Unigenes可能参与金龙胆草主要活性成分三萜皂苷、特征成分苦蒿素、金龙胆草黄酮及金龙胆草多糖的生物合成。金龙胆草转录组测序工作的完成,极大地扩充了金龙胆草的基因资源,为药用功能基因的发掘与利用、遗传改良及有效成分含量的提高等研究奠定基础。
关键词
金龙胆草;转录组注释;代谢途径;有效成分;生物合成
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